最終回では、越山高校野球部がついに決勝進出を決めるも、甲子園出場に高額費用がかかることが発覚。校長の丹羽（小泉孝太郎）が地元の有力者たちを集め、みんなで頭を悩ませる中、部員たちは監督・南雲（鈴木）の家で決勝への決意を固めるのだった――。
ネット上では、「主演が鈴木亮平さんでよかった！ 南雲監督の言葉が心に突き刺りまくりだった」「最終回、本当の試合を観戦しているような錯覚に陥りました。上質なスポ根ドラマだった」と賛辞が続出。
一方、“スポ根もの”という共通点から、2019年7月期に同枠で放送された大泉洋主演『ノーサイド・ゲーム』と比べる視聴者も多く、「『ノーサイド・ゲーム』にの最終回と比べると、いまいち感動しきれなかった」と不満の声も散見される。
「最終回も通常通り1時間放送だった『下剋上球児』ですが、視聴者からは『最終回が駆け足で残念だった』『最後のほうは、時間が足りていない印象だった』という意見も目立ちます。前期の同枠『VIVANT』が、最終回など数話を“25分拡大スペシャル”として放送していたこともあり、『なぜ今回は1時間なのか？』とブーイングも起きているようです」（テレビ誌記者）
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